La Biblioteca del Instituto de Enseñanza Secundaria Marqués de Santillana
se crea con el Instituto de Bachillerato de Colmenar Viejo (1963). Se trata de la clásica Biblioteca escolar de un centro de enseñanza media, con fondos de literatura y libros especializados de las diferentes materias que se impartían en el antiguo Bachillerato y en el posterior BUP.

Durante este periodo la biblioteca padeció los problemas inherentes a estas instituviones, la más significativa de las cuales es la ausencia de un
encargado permanente. Ello suponía dificultades a la hora de unificar criterios de clasificación y ordenación del fondo. Se siguió un sistema basado en la CDU pero que primaba la estructura por departamentos: todos los libros que compraba el Seminario de Matemáticas se les asignaba la clave 51, aunque su contenido no fuese propio de las matemáticas. Así se originaron curiosas duplicidades: un mismo título de Ortega y Gasset tenía ejemplares en Filosofía, Literatura y Arte.

    El espacio físico ocupado por la Biblioteca se encontraba en el pasillo lateral izquierdo (ala norte) cerca de Jefatura de Estudios. La Sala de Lectura albergaba también el depósito de libros, con la innegable ventaja del fácil acceso de los lectores y los inconvenientes de mantener los ejemplares ordenados. En el año 1994, la biblioteca se trasladó a la antigua aula de exámenes (que a su vez era la antigua capilla), habilitándose una zona para Sala de Lectura y otra para Depósito de Libros.

    La inclusión de nuestro Centro en el Plan de Mejora Anual del Ministerio de Educación, en el curso 1997-98, permitió un incremento de los fondos y la inclusión de vídeos, programas de ordenador y discos compactos de
música tanto sinfónica como moderna.